大邑县疾病预防控制中心成立于2002年11月，是县政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益一类事业单位，四川省二级甲等疾控机构，隶属于大邑县卫生健康局，在县卫健局的直接领导下负责履行疾病预防控制职能，是全县疾病预防控制、公共卫生技术指导中心，是实施政府行为，带有社会公益性质，能够承担法律责任的实体。

中心现占地30.05亩，建筑面积3200㎡，中心下设10个科室：办公室（总务科）、党群办、财务科、地病消杀灭科、卫生科、性病艾滋病（结核病）科、慢病健教科、传防免规科、应急质控科、检验科。中心核定编制87人，现有在编职工68人，其中卫生专业技术人员47人，高级职称6人，中级职称27人。

2015年3月，中心取得食品检验机构资质认定证书和实验室计量认证证书，2018年1月顺利通过检验检测机构资质认定复评审，2018年12月顺利通过扩项评审，2019年实现血吸虫病消除达标并成功创建二级甲等疾控机构，2023年成功创建省级慢病示范区。

2020年被成都市评为新冠肺炎疫疫情防控“工人先锋号”、成都市抗击新冠肺炎疫情先进集体；2021年四川省慢性病防控工作综合评估死因监测评估先进单位。